Ο τακτικός οικονομικός έλεγχος της διαχείρισης της Δ.Ε.Υ.Α. ενεργείται από δύο ορκωτούς ελεγκτές λογιστές οι οποίοι είναι εγγεγραμμένοι στο Μητρώο Ορκωτών Λογιστών και διορίζονται από το Γενικό Γραμματέα της Περιφέρειας στην αρχή κάθε οικονομικού έτους.